Миколаїв поділений на чотири райони:
Центральний район розташований на північному заході міста. Він включає історичний центр Миколаєва, Ракетне урочище, Темвод, Соляні, Північний, Тернівку, Матвіївку, Варварівку.
Заводський район розташований на заході міста. У цьому районі зосереджено багато промислових підприємств. У нього входять мікрорайони «Ліски» та «Намив», колишні селища Велика Корениха і Мала Корениха.
Інгульський район розташований на сході Миколаєва. Крім іншого, він включає Нове Садівництво, ПТЗ, Новий Водопій, Старий Водопій. На території району розташовані зоопарк, автобусний і залізничний вокзали.
Корабельний район розташований на півдні міста. Він включає Широку Балку, Богоявленськ (Жовтневе), Балабанівку, Кульбакіно.